Camir Ricketts – NVIDIA 技術博客
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Wed, 08 Jun 2022 07:16:07 +0000
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使用 NVIDIA Clara Parabricks 3.8 進行大規模癌癥基因組測序分析和變異注釋
http://www.open-lab.net/zh-cn/blog/scale-cancer-genome-sequencing-analysis-and-variant-annotation-using-nvidia-clara-parabricks-3-8/
Mon, 06 Jun 2022 07:03:00 +0000
http://www.open-lab.net/zh-cn/blog/?p=4279
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生物信息學家一直在尋找新的工具來簡化和增強基因組分析管道。 NVIDIA Clara Parabricks 擁有 60 多種工具，能夠在研究和臨床環境中為種系和體細胞工作流程提供準確、快速的基因組分析。 今天，我們宣布發布 NVIDIA Clara Parabricks 3.8 ，特點： 序列數據的快速增長要求更快的變體調用格式（ VCF ）讀寫速度。 Clara Parabricks 3.8 擴展了快速變量注釋、變量后調用、使用 snpswift 支持自定義數據庫注釋以及使用 bcftools 調用變量結果。在 Clara Parabricks 上， snpswift 提供了快速準確的 VCF 數據庫注釋，并利用了廣泛的數據庫。 測序技術的進步擴大了基因組學在臨床腫瘤學中的作用。
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