Chelsea Gomatam – NVIDIA 技術博客
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Fri, 21 Mar 2025 09:13:22 +0000
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借助 NVIDIA Parabricks 和 NVIDIA AI Blueprints，將基因組學和單細胞分析時間縮短至幾分鐘
http://www.open-lab.net/zh-cn/blog/shrink-genomics-and-single-cell-analysis-time-to-minutes-with-nvidia-parabricks-and-nvidia-blueprints/
Fri, 21 Mar 2025 09:13:19 +0000
http://www.open-lab.net/zh-cn/blog/?p=13269
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NVIDIA Parabricks 是一款可擴展的基因組學分析軟件套件，通過加速計算和深度學習解決 omics 挑戰，實現新的科學突破。 NVIDIA Parabricks v4.5 在 NVIDIA GTC 2025 上發布，通過支持最新的 NVIDIA GPU 架構，并通過結合使用 Giraffe 和 DeepVariant 來改進對齊和變體識別，從而支持不斷增長的數據量。該版本還包括改進的功能，并縮短了跨多個行業領先工具 (包括 STAR、FQ2BAM 和 Minimap2) 的分析時間。 Parabricks v4.5 隨附用于基因組學和單細胞分析的全新 NVIDIA AI Blueprints，使生物信息學家和基因組學平臺提供商能夠輕松部署和測試 NVIDIA Parabricks 和 NVIDIA RAPIDS，而無需本地 GPU 或自管理云配置。通過擴展可訪問性，
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利用 NVIDIA Parabricks 加速 Pangenome 比對挖掘新的生物學發現
http://www.open-lab.net/zh-cn/blog/discover-new-biological-insights-with-accelerated-pangenome-alignment-in-nvidia-parabricks/
Mon, 04 Nov 2024 06:11:45 +0000
http://www.open-lab.net/zh-cn/blog/?p=11827
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NVIDIA Parabricks 是一款可擴展的基因組學分析軟件套件，可以通過加速計算和深度學習解決組學挑戰，實現新的科學突破。正如在美國人類遺傳學協會（ASHG）全國會議上宣布的那樣， NVIDIA Parabricks v4.4 引入了新的特性和功能，包括加速的全基因組圖形比對。 Parabricks v4.4 版本的核心新功能是為 Giraffe 提供單端和配對支持，以加速 pangenome 圖形比對。該版本還包括針對 Minimap2 和 GATK HaplotypeCaller 的其他功能，以及工具性能改進。它還擴展了協作范圍，以支持基因組測序和軟件平臺。 版本亮點包括： 最新版本的 Parabricks v4.4 使科學家和研究人員能夠使用 Giraffe 進行 pangenome 比對。
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