Jeff Hammond – NVIDIA 技術博客
http://www.open-lab.net/zh-cn/blog
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Thu, 23 May 2024 04:56:39 +0000
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使用 QUELO-G 和 CUDA 圖進行量子力學增強型藥物研發
http://www.open-lab.net/zh-cn/blog/quantum-mechanics-enhanced-drug-discovery-using-quelo-g-and-cuda-graphs/
Tue, 21 May 2024 04:51:22 +0000
http://www.open-lab.net/zh-cn/blog/?p=10099
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在藥物研發中，人們經常使用基于所謂經典力場的方法，并認為這些方法很有用。然而，人們也廣泛認識到，力場模型中缺少一些重要的物理特性，導致應用受限。 例如，在比較兩種具有不同形式電荷的分子時，力場模型無法提供準確的預測，因為模型中未考慮蛋白質極化。此外，由于缺乏形成和打破化學鍵的能力，這些模型不適用于共價藥物分子。 許多人一致認為，基于量子力學 (管理微觀世界的基本物理學) 的模擬是解決這些問題的方法，但量子力學模擬被認為過于昂貴和耗時，不實用。 QSimulate 近期宣布推出 QUELO-G 平臺，該平臺能夠實現基于量子力學的自由能微擾（FEP）模擬，并實現出色的吞吐量。每個 GPU 卡每天的吞吐量超過 100 納秒，因此這些模擬可以在幾小時內完成。基于量子力學的模擬的直接應用將改變計算機輔助藥物研發，特別是在識別新的藥物分子方面。
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10099
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借助 NVIDIA Grace Hopper 超級芯片簡化 HPC 的 GPU 編程
http://www.open-lab.net/zh-cn/blog/simplifying-gpu-programming-for-hpc-with-the-nvidia-grace-hopper-superchip/
Mon, 13 Nov 2023 06:07:54 +0000
http://www.open-lab.net/zh-cn/blog/?p=8229
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NVIDIA RTX GPU 中的 NVIDIA Grace Hopper 超級芯片 系統為開發者處理 GPU 編程的方式帶來了一些戲劇性的變化。最值得注意的是，CPU 和 GPU 顯存之間的雙向、高帶寬和緩存一致性連接意味著用戶可以在使用單個統一地址空間的同時為這兩個處理器開發應用程序。 每個處理器都保留自己的物理內存，該內存的設計具有與最適合每個處理器的工作負載相匹配的帶寬、延遲和容量特性。針對現有的獨立顯存 GPU 系統編寫的代碼將繼續保持高性能運行，而無需針對新的 NVIDIA Grace Hopper 架構進行修改。 我們最近的博文 借助異構內存管理簡化 GPU 應用程序開發 詳細介紹了單地址空間為開發者帶來的一些優勢，以及它在通過 PCIe 連接至 x86_64 CPU 的 NVIDIA GPU 系統上的工作原理。所有應用程序線程（GPU 或…
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