Jonny Hancox – NVIDIA 技術博客
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Thu, 20 Jul 2023 06:12:48 +0000
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用 MONAI 和 RAPIDS 實時進行全幻燈片圖像分析
http://www.open-lab.net/zh-cn/blog/whole-slide-image-analysis-in-real-time-with-monai-and-rapids/
Thu, 13 Jul 2023 06:10:25 +0000
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數字病理切片掃描儀生成大量圖像。載玻片通常以 40 倍的放大率進行掃描，得到千兆像素的圖像。壓縮可以將每個幻燈片的文件大小減少到 1 或 2 GB ，但這種數據量在移動、保存、加載和查看方面仍然具有挑戰性。要以全分辨率查看典型的完整幻燈片圖像，需要一個網球場大小的監視器。 與組織病理學一樣，基因組學和顯微鏡可以產生數兆字節的數據。有些用例涉及多種模式，將這些數據轉換為更易于管理的大小通常需要進行漸進式轉換，直到只保留最顯著的特征。本文探討了實現這種數據細化的一些方法，使用的分析類型，以及諸如MONAI和RAPIDS可以釋放有意義的見解。以一個典型的數字組織病理學圖像為例，因為這些圖像現在在全球的常規臨床環境中使用。 MONAI 是一套開源、免費的協作框架，旨在加速醫學成像領域的研究和臨床協作。 RAPIDS 是一套開源軟件庫，用于在 GPU 上構建端到端的數據科學和分析管道。
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